我们的使命， 是击退企图破坏作品世界的【病毒】！ 我们要为了守护这个世界而努力！ 曾经号称御宅文化圣地的秋叶原如今也成为了商业街， 动画和漫画的记忆逐渐被忘却，专卖店也逐渐关闭，变得所剩无几。 支撑着作品世界的，是存在于人们…

宝可梦广场是为宝可梦而准备的游戏场所。皮卡丘、波克比、杰尼龟，还有一些大家熟悉的宝可梦们，都在那里快乐游玩。但，皮卡丘与杰尼龟等同伴因为小事跟别的宝可梦吵起来，吵醒了在睡觉的波克比，也引起了一场意外......