钥圈儿出现在皮卡丘和伙伴们面前，将它插进飘浮在空中的神秘钥匙孔，就出现了奇幻王国。钥圈儿似乎拥有通往各个不同世界的钥匙，不知道皮卡丘的钥匙会带领大家前往哪个世界呢？

这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历的故事。

铁剑（高山南 配音）奉父之命潜心钻研剑道，在比赛场上遇见了一生的宿敌鬼丸猛（堀川亮 配音），几番较量之下，鬼丸猛成为了铁剑的手下败将，不甘心的他被风神附体，得到了绝世珍宝风神剑。这边厢，铁剑亦得到了同样拥有强大力量的雷神剑…

<p>美雨（川澄绫子 配音）要去上音乐课，却发现自己忘记带乐谱了，她闷闷不乐的躲在音乐教室里，因为害怕遭到白川老师（宫本充 配音）的责骂而不敢去上课。美雨的好友优希（川上伦子 配音）找到了美雨，说服她翘课，向来都循规蹈矩…

【STORY】 生活着众多从未见过的新的Pocket Monster的新的世界，踏上伊苏地区的旅行。 熟悉的组合，小智和皮卡丘，现在的两人又了微妙的变化，新的关键词是「速度感」和「新鲜感」 在伊苏地区旅行的小智，一个接一个遇到新的Pokemo…